两人商议了一天，刘飞扬带走新军第一团，把第二团留下。同时让德兴阿任新军新的练兵大臣，刘洪恩任新军副练兵大臣，但实际由刘洪恩主管，同时新军在上海继续扩军。最重要的是曾国荃同意刘飞扬继续有新军的指挥大权，在大清国谁建的军由谁指挥。

    最后刘飞扬向曾国荃举荐上海同知郑成明当任上海道道台，这事曾国荃作不得主，但答应会向朝庭朝庭举荐。

    刘飞扬在南京商议一完就连夜顺江返回上海，开始他的迁任台湾的准备。

          

    1889年3月10日，刘飞扬率领新军第一团和各式装备，还有在上海召集的一些人才开赴台湾，当他的台湾巡府。

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